菌落總數(shù)就是指在一定條件下（如需氧情況、營養(yǎng)條件、pH、培養(yǎng)溫度和時間等）每克（每毫升）檢樣所生長出來的細菌菌落總數(shù)。菌落總數(shù)的測定主要是作為判定食品被細菌污染程度的標志，也可以應用這一方法觀察食品中細菌的性質(zhì)以及細菌在食品中繁殖的動態(tài)，以便對被檢樣品進行衛(wèi)生學評價時提供科學依據(jù)。目前，菌落計數(shù)一般采用的是平板菌落計數(shù)法，是種統(tǒng)計物品含菌數(shù)的有效方法。
在常規(guī)的微生物學實驗中，不管是食品衛(wèi)生細菌學檢測，還是藥品微生物限度檢查，還是研究活性物質(zhì)的抑菌性能實驗，都常常需要對樣品中的微生物進行定量或者濃度計算；眾多微生物定量方法中常用的就是對培養(yǎng)后的皮氏培養(yǎng)皿上所生長菌落進行總數(shù)統(tǒng)計的菌落總數(shù)統(tǒng)計定量方法。
全自動菌落計數(shù)系統(tǒng)由圖像采集系統(tǒng)和菌落統(tǒng)計分析軟件構(gòu)成，具有菌落統(tǒng)計、典型菌篩選、菌株特征檢測與描述等功能，適用于生物醫(yī)藥、檢驗檢疫、疾病控制、質(zhì)量監(jiān)督、環(huán)境監(jiān)測、食品衛(wèi)生，以及大專院校、研究院所等領(lǐng)域中的微生物菌落分析和科學研究。
快速菌落統(tǒng)計：
1.單一顏色快速統(tǒng)計：對單色菌落、多色菌落、小菌落、大菌落、顏色菌落和蔓延菌進行快速統(tǒng)計。
2.微小菌統(tǒng)計：適應于微小菌落的統(tǒng)計。
3.特大菌統(tǒng)計：區(qū)域內(nèi)大菌落的快速統(tǒng)計，該算法偏重于大菌落統(tǒng)計。
4.與背景色相似菌統(tǒng)計：區(qū)域內(nèi)菌落與培養(yǎng)皿背景顏色相似時，采用背景色相似菌統(tǒng)計。
5.黏連菌統(tǒng)計：適用于背景顏色單一、菌落顏色不*且邊緣模糊的菌落快速統(tǒng)計。
6.分散菌統(tǒng)計：對邊緣清晰，分散的菌落進行快速統(tǒng)計。
